基因芯片技术服务 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 RNA m6A甲基化测序(MeRIP Seq) |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR(MazF酶切法)技术服务 |
基因芯片技术服务 DNA甲基化芯片 DNA羟甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS测序技术服务 DNA甲基化测序 DNA羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
蛋白相对定量 TMT标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 TMT标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
第二军医大学孙树汉教授课题组使用Arraystar Human LncRNA芯片研究肝癌,陆续在发表了两篇Hepatology文章;近期,其课题组的研究成员应用Arraystar Mouse LncRNA芯片,首次发现了能抑制肝癌转移的新LncRNA——Dreh,该研究成果刊登在国际著名肝病研究杂志Hepatology上。 (芯片实验均由LEHU乐虎给予技术服务)
研究背景
乙型病毒性肝炎是华人人群中肝癌的首要因素。乙肝病毒表达的HBx蛋白能促进肝脏肿瘤的形成,但其分子机制仍不清楚。孙树汉教授课题组本次研究目的在于揭示HBx和热点分子——非编码RNA之间的关联。
研究思路
应用美国Arraystar公司Mouse LncRNA V2.0芯片,研究人员分别对6只HBx转基因小鼠和对照组小鼠肝脏的LncRNA表达谱进行研究,筛选出差异表达的长链非编码RNA,其中LncRNA.Dreh(AK050349)表达量在所有年龄和性别的转基因小鼠中都显著下调,因此研究者将目标锁定在该分子上。
研究者对LncRNA.Dreh进行深入的功能分析,发现其能抑制细胞的增殖和迁移;进一步的研究发现LncRNA.Dreh抑癌作用背后的分子机制:它能结合中间丝蛋白并抑制其表达,顺利获得改变细胞骨架结构和形态,阻止癌细胞的转移。
由于LncRNA.Dreh的保守性很高,在对50例临床样本(肝癌组织v.s.癌旁组织)的研究中发现:该分子在癌组织中表达量比正常组织低,并且和病人的预后相关;LncRNA.Dreh表达量高的病人复发率低并且生存期长。
研究意义
该研究首次将乙肝病毒自身表达的HBx蛋白和肝脏组织中的LncRNA关联起来。发现了LncRNA对细胞骨架结构的调控作用,由此来抑制癌细胞的转移。找到了新的肝癌预后标志物,其研究有着重大的临床意义。
原文出处
HBx-related lncRNA Dreh inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by targeting the intermediate filament protein vimentin. Hepatology. 2012.